В связи с тем, что Банк Сантандер продает свою российскую дочернюю компанию ЗАО «Сантандер Консьюмер Банк» в средствах массовой информации появились сообщения о том, что прекращаются и совместные научно-образовательные программы Сибирского федерального университета и Банка.
29 сентября 2010 года в СМИ опубликованы комментарии заместителя руководителя Красноярского УФАС России Олега Харченко (http://newslab.ru/news/337320) по поводу результатов открытого конкурса на право заключения муниципального контракта на выполнение научно-исследовательских работ по обследованию пассажирских потоков общественного транспорта г. Красноярска с дальнейшей разработкой стандарта качества обслуживания населения города пассажирским транспортом общего пользования.
В некоторых СМИ появилась недостоверная информация, о том, что «в СФУ выдали 150 недействительных дипломов».
Данная информация не соответствует действительности.
16 апреля 2010 года Красноярское УФАС России на собственном официальном сайте разместило информацию о том, что государственный контракт на выполнение работ по ремонту общежития университета по адресу ул. Борисова, 8 заключён с нарушениями требований Закона о размещении заказов, а подпись под государственным контрактом подделана проректором по экономике и финансам П.М. Вчерашним.
9 ноября 2009 года Управление Федеральной антимонопольной службы по Красноярскому краю признало необоснованными 44 жалобы в отношении Сибирского федерального университета.
Сибирский федеральный университет 
