Распоряжением Правительства РФ Евгений Ваганов назначен ректором СФУ
Председатель Правительства РФ В.В. Путин 14 июля 2010 г. подписал Распоряжение №1155-р «О назначении Ваганова Евгения Александровича ректором федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Сибирский федеральный университет» сроком на 3 года.