26 мая 2012 года на XIII съезде «Единой России» ректор Сибирского федерального университета Евгений Ваганов принят в ряды партии. Также Евгений Александрович вошел в состав Высшего совета «Единой России».
Евгений Ваганов рассказал: «Все эти пять лет, развивая федеральный университет, я как ректор реализовывал государственную задачу, поддержанную партией. Вполне логично, что, разделяя идеологию «Единой России» в образовательной сфере, решил вступить в её ряды. То, что это сделано сейчас, спустя несколько лет после создания партии, говорит о том, что это решение продуманное. Конечно, я уже не планирую делать партийную карьеру — хватает работы в университете, но, возможно, это станет примером для молодых».
Партийные билеты новые члены «Единой России» получили из рук лидера партии Дмитрия Медведева.