Прием объявлен на 82 программы магистерской подготовки по широкому спектру направлений, что позволит поступающим выбрать наиболее эффективную для себя программу.
Для всех направлений магистерской подготовки в 2009 году предусмотрено вступительное испытание по английскому языку — неконкурсное. Практически для всех программ в качестве профильного вступительного испытания утверждено собеседование по профилю направления — конкурсное.
Впервые Правилами приема в магистратуру СФУ предусмотрена возможность учета академических результатов предыдущей образовательной ступени (бакалавриата).
П. 5.3 Правил приема позволяет в качестве результата вступительного испытания профильной направленности, по желанию поступающего, засчитать результат государственного экзамена бакалвриата.